@mastersthesis {26447,
	title = {An{\'a}lises de QTL e gen{\^o}mica comparativa para estudar mecanismos regulat{\'o}rios da H+-ATPase de membrana},
	year = {2021},
	type = {Tese de doutorado},
	abstract = {A H+ -ATPase {\'e} uma prote{\'\i}na presente na membrana citoplasm{\'a}tica de plantas e fungos e desempenha um papel essencial na gera{\c c}{\~a}o de um gradiente eletroqu{\'\i}mico de pr{\'o}tons, importante para a capta{\c c}{\~a}o de nutrientes e regula{\c c}{\~a}o do pH intracelular. A ativa{\c c}{\~a}o da H + -ATPase da membrana citoplasm{\'a}tica em Saccharomyces cerevisiae induzida por glicose {\'e} supostamente atribu{\'\i}da a um sinal de c{\'a}lcio intracelular correlacionado ao metabolismo do fosfatidilinositol. Em estudos anteriores do nosso grupo de pesquisa, foi observada diferen{\c c}a de fen{\'o}tipo entre as cepas S. cerevisiae BY4742 arg82Δ e PJ69 arg82Δ atrav{\'e}s do teste de atividade da H + -ATPase, indicando que o fen{\'o}tipo de maior ativa{\c c}{\~a}o da H + -ATPase est{\'a} relacionado a v{\'a}rios genes. Diante do exposto, o objetivo deste trabalho foi utilizar diferentes abordagens gen{\^o}micas para identificar novos componentes da regula{\c c}{\~a}o induzida por glicose da H + -ATPase. Para isso, foram realizados o sequenciamento do genoma segregante agrupado, mapeamento de QTLs e an{\'a}lises de Bioinform{\'a}tica para identificar o poss{\'\i}vel motivo da diferen{\c c}a de fen{\'o}tipo e, ou, novos componentes desta via de transdu{\c c}{\~a}o de sinal. Uma vez identificadas as variantes na an{\'a}lise de mapeamento de QTL foi desenvolvido o script SNPsInQTLselection.py para identificar as bases gen{\'e}ticas que podem estar envolvidas com o fen{\'o}tipo de maior atividade da H+ -ATPase. Ap{\'o}s a utiliza{\c c}{\~a}o desse script foram identificadas 42 variantes em 33 genes potencialmente envolvidos com o fen{\'o}tipo de interesse. Para prioriza{\c c}{\~a}o desses genes candidatos foi realizado an{\'a}lise de enriquecimento e interatoma que permitiram identificar 10 genes enriquecidos e envolvidos na via da telomerase e do fosfatidilinositol (STT4, PIK2, UGA2, EST1, MEC3, HEK2, TOP3, PSO2, STO1, FUR4). Cepas do background BY contendo essesrespectivos genes deletados (cole{\c c}{\~a}o EUROSCARF) foram utilizadas para teste de fen{\'o}tipo de acidifica{\c c}{\~a}o extracelular e sinaliza{\c c}{\~a}o de c{\'a}lcio induzida por glicose. Por meio desses testes, 4 (UGA2, FUR4, EST1 e STT4) dos 10 genes enriquecidos, apresentaram o fen{\'o}tipo de maior ativa{\c c}{\~a}o da H+ -ATPase, fen{\'o}tipo esse evidenciado nos testes de acidifica{\c c}{\~a}o extracelular e sinal de c{\'a}lcio. Destes 4 genes, vale destacar o STT4 visto que, de acordo com a fun{\c c}{\~a}o descrita para esse gene na literatura o fosfatidilinositol-4-fosfato pode exercer um papel na regula{\c c}{\~a}o da via de ativa{\c c}{\~a}o de H + -ATPase, controlando a atividade da fosfolipase C. Tendo em vista uma rela{\c c}{\~a}o positiva entre atividade da H + - ATPase e desempenho fermentativo, estudos futuros podem ser feitos com os genes/alelos identificados neste trabalho, com aplica{\c c}{\~a}o em cepas de leveduras industriais 8 visando a melhoria na efici{\^e}ncia de processos fermentativos. Os genes (UGA2, FUR4, EST1 e STT4) merecem investiga{\c c}{\~a}o detalhada para verifica{\c c}{\~a}o do poss{\'\i}vel envolvimento na via de sinaliza{\c c}{\~a}o da H+ -ATPase. Esse trabalho apresenta pela primeira vez uma estrat{\'e}gia de Bioinform{\'a}tica para identificar genes candidatos quando o resultado do mapeamento de QTL n{\~a}o for significativo.},
	url = {	http://www.repositorio.ufop.br/jspui/handle/123456789/13846},
	author = {Patr{\'\i}cia Gon{\c c}alves Prates Barbosa}
}
